Научно-истраживачке дјелатности Завод планира да реализује кроз два програма:

1. Програм из области селекције и оплемењивања стрних жита

Најзначајнија активност Завода је програм оплемењивања стрних жита (пшеница, јечам, раж, тритикале, зоб). Стварање нове сорте траје најмање 10-ак година, од почетка првих активности па до остваривања пуног циља, односно увођења сорте у производњу. Задњих десет година Заводу за стрна жита признато је:

• 14 сорти озиме пшенице: Сарајка, Укрина, Плива, Реа, Врбас, Стојанка, Јелена, Гранада, Бањалучанка, од којих се Кристина, Приједорчанка, Орион, Босанка и Нова Босанка налазе у производњи.
• 2 сорте тритикалеа Виктор и Оскар
• 2 сорте јечма Озирис и Коста
• 1 сорта ражи Октавија
• 1 сорта овса(ражи) Сана

Наведене сорте се налазе у производњи у Републици Српској и Федерацији БиХ, које су потврдиле свој квалитет на тржишту у конкуренцији са страним сортама.

Поред рада на основним врстама жита Завод ради и на сродним врстама, као што су Triticum durum, Т. turgidum, Т. spelta и Т. monococcum , Т. dicoccum. Овај посао може бити веома перспективан јер Завод располаже са богатом колекцијом биљних гена – 2000 генотипова.

2. Програм из области агротехнике стрних жита

Поред проблематике из оплемењивања стрних жита Завод се бави и пословима који су везани за проблематику агротехнике стрних жита. Ово су неодвојиви послови јер створену сорту треба испитати на различитим локалитетима за различите агротехничке параметре.